Pythagoras, der geniale griechische Philosoph und Mathematiker, gab der kleinen Stadt, die einen der schönsten Häfen der Insel besitzt, ihren heutigen Namen.
Während der Herrschaft des Tyrannen Polykrates (538 bis 522 v. Chr.) stand hier die große antike Stadt Samos, deren Reste heute zum Teil freigelegt sind und besichtigt werden können.
Entlang der Hafenpromenade und in den Gassen von Pythagorion lässt es sich gut einkaufen und die vielen Restaurants sind meist gut besucht.
Lage: Pythagorio, Samos 831 03 (ca. 14 km südlich von Samos-Stadt)